色んな事が重なって、
とても辛く寂しくなってるところに、
勇気をもって質問として相談したのが凄いです!
先ずは、保健室登校など学校側が出席扱いしてくれる方法(妹の場合はフリースクールに行く事で出席扱いしていただいてました)を、
保健室の先生なり、相談員さんが来ているなら相談する事です。
口で言うのが辛いのでしたら、文字にして伝えてみて下さい。
それでも難しいのでしたら、再度親御さんに相談するしかないですが；
いい解決策が見つかればと思います。